Aplicações
Revele mecanismos epigenéticos em amostras difíceis
Há mais na história do que a sequência de DNA
A sequência genética por si só não representa o quadro completo da expressão gênica ou da função celular. Os mecanismos epigenéticos, incluindo a metilação do DNA, podem influenciar a atividade gênica sem alterar a sequência do DNA.
A metilação do DNA é uma modificação estável, hereditária e covalente ao DNA, ocorrendo principalmente nos dinucleotídeos CpG, mas também é encontrada em locais não-CpG. A metilação está associada a processos normais de desenvolvimento, assim como as mudanças que são observáveis durante a oncogênese e em outros processos patológicos, como o silenciamento de genes supressores de tumores ou genes reparadores de DNA.
O grau de metilação de DNA pode ser desafiador em amostras de FFPE e biópsia líquida, amplificando a necessidade de soluções robustas e confiáveis que funcionem com amostras de baixa input. As soluções da Amostra à Descoberta da QIAGEN para aplicações epigenéticas abordam esses desafios e fornecem dados confiáveis e descobertas poderosas.
Hipometilação vs. Hipermetrotilação
Sequenciamento de metilação direcionada
O fluxo de trabalho mais rápido com a menor input de amostras para análise de metilação
- Alto desempenho de amostras de tecido, FFPE e biópsia líquida com apenas 1-10 ng de input de DNA
- Vá do DNA para a análise de dados em um dia
- Fluxos de trabalho de análise integrada para o pesquisador não-bioinformático
- Flexibilidade para personalizar ou projetar totalmente os painéis para seu projeto
Você está vendo uma variante verdadeira ou um falso positivo?
Cada molécula de DNA tratada com bissulfito é etiquetada com um índice molecular único (UMI) antes da amplificação. Durante a análise, as duplicatas de PCR e os falsos positivos são removidos para dar um perfil preciso da metilação.
Você consegue cobrir todas as regiões, incluindo as regiões com alto conteúdo de GC?
A tecnologia de single primer extension (SPE) utiliza apenas um primer específico e um primer universal para cada amplicon, em comparação com a abordagem tradicional de 2 primers.
Isto significa que:
- Há um menor risco de dímeros de primer e dropouts
- Maior uniformidade
- Maior complexidade da biblioteca
- Apenas um único conjunto de primers é necessário
- Quer aumentar o conteúdo do seu painel? A SPE não requer um redesenho de primer!
