Aplicações
Sequenciamento do DNA
Desfaça a complexidade do genoma com soluções de DNA-seq
Se você estiver interessado em detectar variantes de DNA ou identificar fusões de RNA conhecidas e novas, os fluxos de trabalho complexos, longos tempos de retorno e amostras limitadas podem impedir o progresso, aumentar os custos e atrasar dados acionáveis. Nossas tecnologias de sequenciamento de DNA de alto desempenho (DNA-seq) são otimizadas para superar tais desafios, permitindo que você possa sequenciar regiões ricas em GC com confiança, identificar com precisão variantes de baixa frequência e obter o máximo das amostras de baixa qualidade ou escassas. Para te ajudar no desenvolvimento dos seus painéis, nossos especialistas estão à disposição para te ajudar no no desenvolvimento dos seus painéis.
Perspectivas genômicas feitas pelo QIAseq
As soluções QIAseq são baseadas em três pilares para minimizar o viés e maximizar a cobertura do genoma, uniformidade e precisão.
Ampliação imparcial e correções de erros
Cobertura uniforme
Reduz os erros de leitura
Sequenciamento por Amplicon
Redefinindo o sequenciamento por amplicon: encontrando as variantes que importam em DNA-seq
Duplicações da PCR, falsos positivos e enviesamento de bibliotecas podem prejudicar a qualidade de seus dados de sequenciamento direcionados. Introduza precisão e confiança em seu fluxo de trabalho, adotando a abordagem de sequenciamento de DNA digital.
Nossos painéis de sequenciamento de DNA ,com curadoria especializada, utilizam índices moleculares únicos para garantir uma cobertura superior de:
- Regiões genômicas ricas em GC
- Regiões exonicas de genes
- Hotspots
- SNPs
- Regiões intrônicas e promotoras
Erro ou mutação de baixa frequência?
O sequenciamento de regiões alvo no DNA com painéis é uma abordagem poderosa para detectar variantes de baixa frequência. Entretanto, uma grande desvantagem é que todos os fragmentos de DNA parecem exatamente iguais, tornando quase impossível distinguir erros de sequenciamento e moléculas únicas de DNA.
Isto limita sua capacidade de detectar com confiança variantes de DNA de baixa frequência. Isso não acontece com o QIAseq, pois todos os painéis de catálogo e os personalizados contêm índices moleculares únicos, que marcam as moléculas de DNA originais e eliminam leituras falsas devido a erros de PCR, polimerase e leitura pela máquina.
Acesse as regiões mais difíceis do genoma
Os produtos QIAseq incluem buffers e enzimas de sequenciamento baseado em amplicon otimizados e enzimologia, permitindo que você tenha acesso às regiões mais difíceis do genoma. A química usada nos painéis de DNA QIAseq Targeted DNA e fluxo de trabalho é compatível tanto com as regiões genômicas regulares quanto com as regiões ricas em GC. Atinja 100% de cobertura para genes ricos em conteúdo de GC, como CEBPA e CCND1, usando métodos inovadores.
Métricas de sequenciamento excepcionais
Uniformidade: os painéis padrão normalmente atingem uniformidade de 99,5% a 0,2x de cobertura média e 96% a 0,5x de cobertura média.
Sensibilidade: ganhe maior confiança no sequenciamento de variantes de DNA de baixa frequência. Os painéis padrão podem obter mais de 90% de sensibilidade para 1% NA12878 SNP e deleção em uma região de codificação típica com falsos positivos de menos de 15 por região de megabase.
Mais multiplexação: os produtos de outros fornecedores oferecem 96 amostras de multiplexação. O QIAseq não para por aí: 384 amostras podem ser multiplexadas usando índices específicos para o QIAseq.
Sequenciamento do exoma completo
Da amostra para o resultado final em tempo recorde
Fluxo de trabalho otimizado, para seq. exoma, com tempos de ensaio reduzidos que te levam da amostra à classificação de variantes e interpretação.
Perspectivas genômicas feitas pelo QIAseq
As soluções QIAseq são baseadas nas seguintes inovações para minimizar o viés e maximizar a cobertura do genoma, uniformidade e precisão.
- Redução de até 50% do custo por amostra
- Automatizável
- Escalonável com facilidade
- Obtenção de FASTq para chamada de variantes 57% + rápido
- Fluxo de trabalho analítico singular ou em trio pré-configurados
- Eliminação do processo de curadoria manual ou assinaturas de banco de dados externo
- Interpretação acelerada em larga escala para resultados mais rápidos
Sequenciamento do exoma automatizável e escalonável com um único dia de trabalho
Você examina o exoma para identificar as variantes causadoras de doenças, mas está preocupado com a uniformidade da cobertura devido à composição da GC?
Detecte as variantes patogênicas com confiança, facilidade e eficiência com nosso fluxo de trabalho escalável de um dia, compatível com automação. Com base na tecnologia de captura híbrida, os kits QIAseq Human Exome Kits garantem:
- Análise de variantes altamente sensíveis de alvos de >500 genes
- Redução dos custos de sequenciamento por amostra em 50%
- Redução de 40% no tempo total de respostas por amostra
A integração perfeita com o QIAGEN CLC Genomics Workbench permite uma rápida análise de variantes e o QCI Translational assegura uma interpretação precisa das variantes e percepções específicas da doença – sem o esforço da curadoria manual.
Sequenciamento do genoma completo
Tenha uma visão abrangente do genoma
O genoma inteiro e a sequência de captura híbrida proporcionam uma visão holística e inigualável de todo o genoma, mas podem ser consideradas abordagens de tempo e custo intensivo. As soluções QIAseq tornam essas metodologias mais acessíveis, maximizando a qualidade dos dados por amostra .
Beneficie-se de:
- Químicas avançadas para permitir “inputs” de amostras em picrogramas, através de protocolos rápidos e automatizáveis.
- Fragmentação enzimática do DNA – não há a necessidade de equipamentos para quebra mecânica do DNA
- Aumento da eficácia na etapa de ligação, gerando altas taxas de conversão e rendimento – sem formação de dímeros de primers.
- Representação uniforme G/C de qualquer organismo
- Kits com adaptadores dual-barcoded incluídos
Metagenômica
Decifrando a diversidade microbiana
Dados metagenômicos são usados para examinar as espécies presentes em microbiomas naturais ou saudáveis, quantificar a abundância de genes virulentos ou de resistência a antibióticos, ou lançar luz sobre as causas, efeitos e terapias futuras para uma variedade de doenças. Desde o sequenciamento de amplicon até a análise metagenômica completa de uma amostra de DNA, as soluções QIAseq NGS são projetadas para desvendar a complexidade genômica de sua amostra.
Soluções Genômicas
Combinação da experiência, suporte inigualáveis e nossas tecnologias QIAseq de alto desempenho
Faça parte da revolução genômica. Seja parceiro da QIAGEN para se beneficiar de mais de 20 anos de experiência em soluções Da Amostra à Descoberta. Do projeto do painel à análise – nossas Soluções Genômicas simplificam a descoberta de biomarcadores para impulsionar sua pesquisa.
